Embora seja focada nos mutantes da Marvel, X-Men ’97 não tem qualquer receio em explorar a aparição de outros personagens importantes da editora. Ainda que nem todos tenham participações ativas na série, o fato de eles estarem presentes ajuda a enriquecer a trama e a mostrar que as aventuras fazem parte de um universo mais extenso.
No último capítulo da primeira temporada, lançado na Disney+ no dia 15 de maio, os roteiristas foram além e mostraram muitas figuras amadas e reconhecidas pelos fãs. Enquanto nem todos têm um grande tempo de tela, sua presença dá esperanças de que a série possa ser somente o primeiro passo para a construção de um universo de animações interconectadas entre si.